Loschmidtovy laboratoře proteinového inženýrství

Články

• Automated Engineering Protein Dynamics via Loop Grafting: Improving <i>Renilla</i> Luciferase Catalysis

  PLANAS IGLESIAS Joan MAJEROVÁ Marika PLUSKAL Daniel VAŠINA Michal DAMBORSKÝ Jiří PROKOP Zbyněk MAREK Martin BEDNÁŘ David

  Článek v odborném periodiku

  ACS Catalysis, rok: 2025, ročník: 15, vydání: 4, DOI

• Biochemical and Computational Characterization of Haloalkane Dehalogenase Variants Designed by Generative AI: Accelerating the SN2 Step

  GELFAND Natalia OREL Vojtěch CUI Wenqiang DAMBORSKÝ Jiří LI Chenglong PROKOP Zbyněk XIE Wen Jun WARSHEL Arieh

  Článek v odborném periodiku

  Journal of the American Chemical Society, rok: 2025, ročník: 147, vydání: 3, DOI

• Discovery of new inhibitors of nuclease MRE11

  NIKULENKOV Fedor CARBAIN Benoit Jean-Pierre BISWAS Raktim HAVEL Štěpán PROCHÁZKOVÁ Jana SISÁKOVÁ Alexandra ZACPALOVÁ Magdaléna CHAVDAROVA Melita MARINI PALOMEQUE María Victoria VŠIANSKÝ Vít WEISOVÁ Veronika SLÁVIKOVÁ Kristína BIRADAR Dhanraj Omprakash KHIRSARIYA PrashantKumar VITEK Marco SEDLAK David BARTUNEK Petr DANIEL Lukáš BREZOVSKÝ Jan DAMBORSKÝ Jiří PARUCH Kamil KREJČÍ Lumír

  Článek v odborném periodiku

  European Journal of Medicinal Chemistry, rok: 2025, ročník: 285, vydání: March, DOI

• Engineering Dehalogenase Enzymes Using Variational Autoencoder-Generated Latent Spaces and Microfluidics

  KOHOUT Pavel VAŠINA Michal MAJEROVÁ Marika NOVÁKOVÁ Veronika DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David MAREK Martin PROKOP Zbyněk MAZURENKO Stanislav

  Článek v odborném periodiku

  JACS AU, rok: 2025, ročník: 5, vydání: 2, DOI

• Glycated α-Synuclein Renders Glial Cell Activation and Induces Degeneration of Dopaminergic Neurons: A Potential Implication for the Development of Parkinson's Disease

  CHATTERJEE Sayan VERMA Arvind THAKKAR Harsh SHAH Ravi P KHAIRNAR Amit Suresh

  Článek v odborném periodiku

  ACS Chemical Biology, rok: 2025, DOI

• Chronic DSS-Induced Colitis Exacerbates Parkinson’s Disease Phenotype and Its Pathological Features Following Intragastric Rotenone Exposure

  SHARMA Nishant SHARMA Monica THAKKAR Disha KUMAR Hemant SMETANOVÁ Soňa BUREŠOVÁ Lucie ANDRLA Petr KHAIRNAR Amit Suresh

  Článek v odborném periodiku

  ACS PHARMACOLOGY & TRANSLATIONAL SCIENCE, rok: 2025, ročník: 8, vydání: 2, DOI

• Increased thermal stability of FGF10 leads to ectopic signaling during development

  CZYREK Aleksandra Anna BARAN Karolina HRUBÁ Eva HORACKOVA Aneta BOSÁKOVÁ Veronika CHUDZIAN Julia FAFÍLEK Bohumil LASKOVA Veronika STEPANKOVA Veronika BEDNÁŘ David KARL Kelly KASPAREK Petr BOSÁKOVÁ Michaela KILLINGER Michal SZOTKOWSKA Tereza PROCHAZKA Jan ZIEBA Jennifer T RICO LLANOS Gustavo FRIČ Jan HADZIC Stefan LOKU Edma WUJAK Magdalena SVOZILOVÁ Kateřina STROBLOVÁ Michaela SEDLACEK Radislav HRISTOVA Kalina KRAKOW Deborah KUBOVCIAK Jan DELATTRE Mathys BARTOSZEWSKI Rafal BUCHTOVÁ Marcela KROWARSCH Daniel CHALOUPKOVÁ Radka ZAKRZEWSKA Malgorzata KREJČÍ Pavel

  Článek v odborném periodiku

  Cellular and molecular life sciences, rok: 2025, ročník: 82, vydání: 1, DOI

• Structure Prediction and Computational Protein Design for Efficient Biocatalysts and Bioactive Proteins

  BULLER Rebecca DAMBORSKÝ Jiří HILVERT Donald BORNSCHEUER Uwe T.

  Článek v odborném periodiku

  Angewandte Chemie International Edition, rok: 2025, ročník: 64, vydání: 2, DOI

• Visual Support for the Loop Grafting Workflow on Proteins

  OPÁLENÝ Filip ULBRICH Pavol PLANAS IGLESIAS Joan BYŠKA Jan ŠTOURAČ Jan BEDNÁŘ David FURMANOVÁ Katarína KOZLÍKOVÁ Barbora

  Článek v odborném periodiku

  IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics, rok: 2025, ročník: 31, vydání: 1, DOI